厨余垃圾处理对维持机体内环境稳态和调节发育过程中的体内天然的合成、释放、转运、代谢、结合和效应造成严重影响的一类外源性物质。可以是天然的，也可以是人工合成的。如邻苯二甲酸酯类、有机氯杀虫剂等。
厨余垃圾处理海洋生物是海水环境和沉积环境污染的直接受害对象，并且海洋环境中的污染物对海洋生物质量的影响具有累积作用，其体内的污染物含量反映了其生存环境的质量，可食用底栖生物质量的好坏对人体健康更是有着直接的影响。目前，我国海洋生物质量状况并不乐观，主要表现为：海洋生物结构失衡，濒危物种减少；主要经济生物体内有害物质残留量偏高；沿岸经济贝类卫生状况欠佳。
厨余垃圾处理土壤污染 是人类活动产生的污染物进入土壤并积累到一定程度，引起土质恶化的现象。主要源于工业、生活废水和固体废物、化肥以及大气沉降物等。