发酵罐关于控制方式，有手动控制和自动控制两类：手动控制：这是简易的控制方法。手动控制方法简单，不需特殊的附加装置，投资费用较少，劳动强度较大，控制的合适也可减少误差。自动控制：采用自动控制时，必须使测定元件产生输出信号并用仪表监视。如测定温度时，可用热电偶代替温度计，并与控制部分相连，控制部分再产生信号驱动执行元件进行操作。
发酵罐基本条件机械搅拌发酵罐是利用机械搅拌器的作用，使空气和发酵液充分混合，促使氧在发酵液中溶解，以保证供给微生物生长繁殖、发酵所需的氧气。又称通用式发酵罐。发酵罐的基本要求结构严密，经得起蒸汽的反复灭菌，内壁光滑，耐腐蚀性能好，以利于灭菌减小金属离子对生物反应的影响;在保持生物反应要求的前提下，降低发酵罐能耗。
发酵罐搅拌器的维护：每次开罐盖后应检查并旋紧安装在搅拌轴上各部件中的止动螺钉。上磁钢位置的调整：上磁钢距罐底间距正常值为1-1.5mm，间距过小上磁钢的底面会触及罐体，这时会引起搅拌轴不能转动或搅拌轴有跳动并伴有较大的噪声现象出现；间距过大，这时会引起上下磁钢间的磁力减小，当发酵液粘稠时有可能搅拌器停转并伴有较大的噪声。