电瓶车智能充电桩系统有三种收费模式；分别是用户投币收费、刷i卡收费和扫码收费。只要充电桩具备这几张收费方式，用户可以自由选择。
绝大多数的电瓶车智能充电桩系统都是按照电瓶车功率进行收费的。就是说不同型号的电瓶车功率不一样，比如48v,12ah的电动车功率是115W，而60v,20ah的电动车功率就是240w的，瓦数越大耗电量越多，那么在充电桩上所花费的充电费用就越贵。
电瓶车智能充电桩系统收费，正常情况下，电动汽车充换电设施用电按其所在场所执行电动汽车用电实行扶持性电价政策，峰谷价差和峰平谷时段保持不变。其次，政i府设立的社会公共停车场中的充换电设施电价按行政事业单位办公场所用也会以电标准执行。