食品生产许可证小作坊食品生产许可证办理主要有以下几方面困难：1、生产场地：取食品生产许可证对生产场地的选址，工艺流程，要求物流要分开防止交叉污染，配备消毒设备，通风系统，采光等都有严格要求。2、生产人员：食品生产许可证审核,要求必须要有实验室,满足产品出厂检验要求。化验员执证上岗，所以需要企业自己去培训化验员.3、设备设施：取证有明确的生产设备和检测设备要求.而小作坊对这些设备的投入费用一般都很难承担.以上就是小作坊食品生产许可证办理方面的问题，对比一般食品生产厂商可能具有一定的难点，请人员来协助办理，才好少走弯路，节省时间。
食品生产许可证食品生产小作坊需要办理的证件：1、工商营业执照：到所在地工商行政管理局（所）办理工商营业执照。2、健康证：到所在地疾病预防控制中心体检并办理健康证。3、食品流通许可证：需带上及复印件、健康证、房屋产权证（或租房合同）等资料到所在地食品药品监督管理局（所）办理食品流通许可证。4、小作坊食品生产许可证：到所在地食品药品监督管理部门申请登记办理。
食品生产许可证办理流程 1.填写食品流通许可证申请书 2.到窗口递交相关资料 3.场地审核 4.证件核发