制定科学的文书档案管理制度要从收集、整理、保管和利用多个环节考虑。在收集方面,明确收集范围、渠道和时间节点。整理环节,规定分类标准,如按性质或来源分类,以及排序方式。保管部分,确定存储环境要求、安全措施和保管期限。利用环节,规范查阅、借阅的审批流程和归还要求。同时,建立监督和奖惩机制,确保制度有效执行,并且要根据实际工作情况和法规要求,定期修订完善制度。