深孔加工是处于关闭或半关闭的状态下，故不能直接观察到刀具的切削状况，由于孔深，切屑经过的路线长，容易发生阻塞，造成钻头崩刀，因此切屑的长短和形状要加以操控，并要进行强制性排屑。
深孔钻削时，散热和排屑困难，且因钻杆细长而刚性差，易产生弯曲和振动，所以对于原材料的选用和订制，结构的设计，特别是外圆的加工、成型槽的磨削、抛光，刃口的处理、涂层的选择上都要面面俱到。
深孔加工操作关键：主轴和刀具导向套、刀杆支撑套、工件支承套等中心线的同轴度应符合要求；切削液体系应疏通正常；工件的加工端面上不应有中心孔，并防止在斜面上钻孔；切屑形状应坚持正常，防止生成直带状切屑；选用较高速度加工通孔，当钻头行将钻透时，应降速或停机以防损坏钻头。