发酵过程中物料的恶臭严重影响了环境和产品品质，解决发酵过程中的恶臭是固体有机废弃物资源化过程中另一个难点。传统的方法是利用一些物理和化学的方法加以防治，但成本高，成果不佳。恶臭的主要来源是NH3、H2S以及一些有机小分子，它们通常是由微生物代谢产生的，抑制这些微生物的生长和繁殖有利于除臭。在发酵过程，可以将硝化细菌、硫化细菌等具除臭能力的菌株，集成到发酵微生物***中，以达到了良好的除臭效果。
复合发酵菌群 兼顾到除臭和减少营养物质的流失等方面的要求就形成了一个集成的发酵微生物菌群。如我国应用较多的EM菌剂，它是一个由乳酸菌、酵母菌、***和光合细菌等1 0个属的80多种微生物菌株组成的复合培养液。
筛下物造粒后，送入由沼气池沼气供热的烘干机，进行烘干，按比例添加中微量元素后搅拌混合后制成成品，进行分装，入库待售。筛上物返回粉碎工序进行回用。