沉井下沉时，就应当做好封底筹备。由于有的沉井在软土中排水下沉时，下沉速度很快，当沉井下沉到设计标高以后，若不及时封底，有可能使沉井偏差增大，大批土体涌进井内，将给封底工作带来艰苦。刃脚第平面称为踏面，其宽度视所遇土层的软硬及井壁重量、厚度等二定，一般不大于15cm。当需穿过坚硬土层或岩层时，踏面宜用钢板或角钢维护。抽水的集水井，要待沉井防水混凝土底板到达设计强度后才结束抽水，用素混凝土填满，然后，用事先筹备好的带螺栓孔德钢盖板和橡皮垫圈盖好，拧紧法兰盘上的所有螺栓。集水井的上口标高，应比钢筋混凝土底板顶面标高下200～300mm，待集水井封口完毕后，再用混凝土找平。

这一阶段应严格控制挖土的程序和深度，注意要均匀挖土，对于结构体大的井体，根据需要，必须安排多个作业面，同时对称均匀挖土。实际上在挖土下沉时不可能是竖直均匀下沉，每沉一次，难免有些倾斜，继续挖土时，可在井体倾斜的反方向一边增大挖土量。在刃脚遇到障碍物的情况下，必须先清除后再下沉。清除方法是人工排除，在不能排水的情况下，由洁水工进行下切割或者水下。为了防止挖土下沉时井壁断裂，沉井降落时要尽量做到均匀挖土，平衡下沉。但由于原始土质的不均匀性和挖土时的不平衡，所以井体在下沉进程中经常会产生不平衡，因此须要及时纠偏，通常采用挖土纠偏的措施。

当沉井降落到设计标高后，沉井地面用混凝土封底，以防地下水渗透井内。当沉井仅作为穿过地表含水层在不透水层中构筑隧道出入口时，可不用封底，但须封住地下水下渗的途径。纠正沉井中位位置发生偏移的方法是先使沉井倾斜，然后均匀除土，使沉井底中心线下沉至设计中心线后，再进行纠偏。沉井下沉至设计标高后，应进行沉降观测，待8h内累计下沉量不大于10mm时，方可进行封底。沉井封底时影响沉井防水后果的要害，封底有拍摄封底和不排水封底。（即干封底和水下封底）两种方式。