恒温快速扩增试剂盒常用酶原料有哪些?
逆转录酶逆转录酶又称反转录酶,是一种RNA介导的DNA聚合酶,其反应过程中体现出三种功能为:以RNA作为模板合成互补DNA链 (complementary DNA, cDNA),形成RNA:cDNA杂交链;发挥RNase H活性,降解RNA:DNA杂交链中的RNA模板;以cDNA作为模板合成第二链DNA,形成双链DNA(如下图)。其中,RNaseH活性是逆转录酶的一个内在特性,可在合成过程中同时切割RNA:cDNA杂合链中的RNA模板,该特性可能降低逆转录效率,因此在实际应用中,常采用人工改造后的低或无RNase H活性的逆转录酶。常用的逆转录酶有AMV和M-MLV,AMV分离自禽类成髓细胞瘤病毒(Avian Myeloblastosis Virus, AMV),M-MLV逆转录酶分离自莫洛尼氏鼠病毒(Moloney Murine Leukemia Virus, MMLV),前者热稳定性优于后者,但AMV逆转录酶的RNaseH活性也更强,不利于长片段cDNA合成。市面上多使用经基因工程改造过的M-MLV逆转录酶,其热稳定性改进,可在50℃左右工作,同时RNase H活性进一步减弱,提高了其逆转录效率。
恒温扩增常用酶
恒温扩增的方法多种多样,其对应的酶体系也各有差别,且一般为多酶体系,在酶原料选择上相比PCR复杂,下面只列举一些主要的恒温扩增方法相关酶。
LAMP相关酶环介导等温扩增技术(Loop-mediated isothermal amplification, LAMP)所用酶主要为具有链置换功能的DNA聚合酶,详细原理可参考聊聊恒温扩增技术。常用酶为Bst DNA聚合酶,用于DNA链合成,同时具有链置换功能;若检测模板为RNA,则可加入逆转录酶配制成RT-LAMP反应体系。
恒温扩增试剂盒常用酶简介
RPA相关酶
重组酶聚合酶扩增技术(Recombinase Polymerase Amplification, RPA)是一种多酶协作的反应体系,详细原理可参考充满想象力的恒温扩增技术:RPA、RCA、SDA、HDA。该体系反应酶包含三种:重组酶:可与引物结合形成复合体,定位至与引物同源的靶序列,促使引物与模板结合,同时帮助DNA解链,以便启动扩增;单链DNA结合蛋白:可与被置换出的DNA单链结合,稳定单链结构;DNA聚合酶:如Bsu DNA聚合酶,用于DNA链合成,同时具有链置换功能。对于RNA模板,需在反应中加入逆转录酶形成RT-RPA体系;若利用标记探针进行检测,还需加入核酸酶对探针序列进行切割,常用核酸酶有核酸内切酶 IV(Endonuclease IV, nfo)和核酸外切酶 III(Exonuclease III, exo),或者可与CRISPS/Cas系统搭配使用。
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