RPA技术的基本原理
RPA技术主要依赖于三种酶:能结合单链核酸(寡核苷酸引物)的重组酶、单链DNA结合蛋白(SSB)和链置换DNA聚合酶。这三种酶的混合物在常温下也有活性,反应温度在37°C左右。
重组酶与引物结合形成的蛋白-DNA复合物,能在双链DNA中寻找同源序列。一旦引物定位了同源序列,就会发生链交换反应形成并启动DNA合成,对模板上的目标区域进行指数式扩增。被替换的DNA链与SSB结合,防止进一步替换。在这个体系中,由两个相对的引物起始一个合成事件。整个过程进行得非常快,一般可在十分钟之内获得可检出水平的扩增产物。RPA扩增的基础体系(TwistAmp? Basic)含有DNA扩增所需的所有试剂,我们只要准备好引物和模板就行。扩增结果可以通过凝胶电泳进行终点检测,产物纯化后可用于下游研究。
在这个基础体系中添入不同的酶和探针,就可以实现多样化的RPA应用。举例来说,TwistAmp? exo结合了的exo探针技术和核酸外切酶III,能实现数据的实时读取,就像荧光定量PCR一样。不过反应终点的扩增子总量有所减少,适合获得强荧光信号进行动力学分析,不适合终点检测(比如跑胶)。将exo探针技术、核酸外切酶III和逆转录酶结合起来,可以一步实现RNA模板的实时扩增。
RPA 的概念
概念:重组酶聚合酶扩增(Recombinase Polymerase Amplification,RPA),被称为是可以替代PCR的核酸检测技术。RPA技术主要依赖于三种酶:能结合单链核酸(寡核苷酸引物)的重组酶、单链DNA结合蛋白(SSB)和链置换DNA聚合酶。这三种酶的混合物在常温下也有活性,反应温度在37°C左右。
TwistDx恒温扩增应用
TwistDx公司开发的重组酶聚合酶扩增(RPA),被称为是可以替代PCR的核酸检测技术。以此为基础的TwistAmp 核酸扩增产品,能够在15分钟内进行常温下的单分子核酸检测。
RPA反应的适宜温度在37℃~42℃之间,无需变性,常温下即可反应,大大加快了PCR的速度。并且由于不需要温控设备,RPA可以真正实现便携式的快速核酸检测。RPA检测的灵敏度很高,能够将痕量的核酸(尤其是DNA)模板扩增到可检出水平,从单个模板分子得到大约1012扩增产物。无需复杂样品处理,即可实地检测;既可扩增DNA也可扩增RNA,省去额外的cDNA合成步骤;检测方式多样:终点检测、对扩增过程进行实时监控或通过侧流层析试纸条(LFD)读取结果。
试剂盒包括两类:①.TwistAmp冻干研发试剂盒(包括TwistAmp Basic试剂盒、TwistAmp exo 试剂盒和TwistAmp nfo 试剂盒共三种);②. TwistAmp液态研发试剂盒(包括TwistAmp Liquid Basic 试剂盒和TwistAmp Liquid exo 试剂盒共两种)
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即用型RPA检测试剂盒
客户采用RPA技术,可以根据自身需求开发自己的检测方法。在不同开发阶段所提供的这些即用型试剂盒内含有一整套用于检测主要食物病原体靶标的通用RPA试剂组分,灵活易用。
TwistDx公司曾经开发出系列即用型RPA检测试剂盒。例如,TwistAmp? exo +试剂盒为用户提供了一个exo试剂盒,加上用于实时荧光检测的引物探针及阳性模板,该模板可与每次检测反应配合使用。TwistGlow? 沙门氏菌(即用型,可用于实时荧光检测)和 TwistFlow? 沙门氏菌(即用型,可用于终点侧流检测)试剂盒均为用户提供包含靶基因及内部质控引物探针反应组分、一个两步走的细胞裂解样本制备方法,以及可与每次试剂盒反应配合使用的模板。
目前,TwistDx公司在被雅培收购后,停产了部分产品,包括:TwistAmp Basic RT试剂盒、TwistAmp exo RT试剂盒、TwistAmp Liquid Basic RT 试剂盒和TwistAmp Liquid exo RT试剂盒、食品安全试剂盒(包括TwistAmp exo 弯曲菌属检测试剂盒(TwistAmp exo +Campylobacter)、TwistAmp exo 单核细胞***李斯特菌检测试剂盒(TwistAmp exo +ListeriaM)、TwistGlow?沙门氏菌检测试剂盒(TwistGlow?Salmonella)和TwistFlow 沙门氏菌检测试剂盒(TwistFlow?Salmonella )共四种)。
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