琼脂糖水平电泳槽
琼脂糖水平电泳槽实验操作
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1. 根据电泳需要,配置合适浓度的电泳及制胶缓冲液。一般为 1× TAE或0.5×TBE。
注意:用于电泳的缓冲液和用于制胶的缓冲液必须是相同的。
2. 根据制胶量及凝胶浓度,在加有一定量的电泳缓冲液的三角锥瓶中,加入准确称量的琼脂糖粉。
注意:总液体量不宜超过三角锥瓶的50%容量。
3. 在微波炉中加热溶解琼脂糖
注意:必须保证琼脂糖充分完全溶解,否则,会造成电泳图像模糊不清。加热时如胶液剧烈沸腾发泡,停止加热。微波炉中加热时间不宜过长。
4.使溶液冷却至60℃左右,如需要可在此时加入EB溶液使其终浓度为0.5ug/ml,并充分混匀(EB为危险品,不提倡使用)。注意:EB是一种致癌物质。使用含有EB的溶液时,请戴用手套。EB在可见光下会分解。
5.将琼脂糖溶液倒入制胶托盘中,然后在适当位置处插上梳子。凝胶厚度一般在5-8 mm 之间。
注意:不要产生气泡,溶液温度太高(>60℃),会使得水分
过分蒸发,改变凝胶离子浓度,影响电泳效果。
6.在室温下使胶凝固(大约30 分钟),然后放置于电泳槽中进行电泳。
注意:凝胶不立即使用时,用保鲜膜将凝胶包好在4℃下保存,或者放在制胶的缓冲液中,一般可保存2~5 天。
蛋白凝胶电泳的分类
蛋白凝胶电泳分为非变性凝胶和变性凝胶
所谓非变性凝胶,即在凝胶中不加SDS和尿素等变性剂,这种凝胶中,蛋白质仍保持活性,其迁移率受它的静电荷与分子大小两个因素的影响。因此在非变性凝胶中进行电泳是不能测得分子量的,常用于酶的鉴定、同工酶分析和提纯。
所谓变性凝胶,即在凝胶中加入变性剂,如尿素、SDS(十二烷基磺酸钠)、DTT等。这些变性剂可以破坏或改变蛋白质的结构,把绝大部分蛋白质分离成组成它们的亚基。同时在蛋白质分子周围包围了大量负电荷。这种电荷基本上掩盖了无变性剂存在时正常就有的任何电荷。蛋白质在这种变性凝胶中的迁移率与它们分子量的对数成直线关系。因此利用变性凝胶进行电泳可以测得蛋白质的分子量。目前应用较多的变性剂为SDS。
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SDS-PAGE电泳
蛋白质在SDS-PAGE电泳中,迁移率只和其分子量相关
PAGE据其有无浓缩效应,分为连续系统与不连续系统,连续系统电泳体系中缓冲液pH值及凝胶浓度相同,带电颗粒在电场作用下,主要靠电荷及分子筛效应;不连续系统电泳体系中由于缓冲液离子成分、pH、凝胶浓度及电位梯度的不连续性,带电颗粒在电场中泳动不仅有电荷效应、分子筛效应,还具有浓缩效应,故分离效果更好。不连续的凝胶作为支持介质,利用凝胶层的不连续性、缓冲液离子的不连续性、PH的不连续性及电位梯度的不连续性,使样品在不连续的两相间积聚浓缩成很薄的起始区带,然后进行分离。
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