一些河泥成为“污泥”，其性质不再适宜直接还田或经过沤肥后作为肥料使用。另一方面，农业生产中化肥的使用越来越普遍，也使得原先用河泥沤制的肥料逐渐丧失了需求。环保清淤与工程清淤的差异在于清淤的底泥厚度很薄，大部分环保清淤工程的底泥为20cm到40cm的居多。因此，对清淤设备本身的定位、操作系统的精度要求很高。

由于近些年港口、航道、内河以及湖泊清淤工程众多，疏浚、清淤技术得到长足发展，装备能力也大大提升，但能够进入中小河道的***船只和设备却并不常见。现在的清淤工程具有系统化施工的特点，在清淤之前应该进行初步的底泥调查。通过测量明确河道底床的形状特征，通过底泥采样分析明确底泥中污染物的特点和是否超过环境质量标准。

无污染淤泥与污染淤泥的处理

淤泥是否污染及含有的污染物种类不同，其相应的处理方法也不尽相同，某些水利工程中产生的淤泥基本上没有污染物或污染物低于相关标准，例如南水北调东线工程淮安白马湖段疏浚淤泥无重金属污染，同时氮磷等营养盐的含量也低，对于此类无污染或轻污染的淤泥可以进行资源化处理，这类淤泥主要产生于工业比较落后的农村地区。