合理的设计净化车间对其净化效果有着很重要的作用。 一、布置合理、紧凑。洁净室或洁净区内只布置必要的工艺设备以及有空气洁净度等级要求的工序和工作室。二、在满足生产工艺要求的前提下，空气洁净度高的洁净室或洁净区宜靠近空气调节机房，空气洁净度等级相同的工序和工作室宜集中布置，靠近洁净区人口处宜布置空气洁净度等级较低的工作室。

以PCR实验室为例，是分子生物学研究和实验的常规方法，也是生物学、医学临床等领域广泛应用的实验技术。其特点是能将微量的DNA大幅增加，实验室通常分为四个区域，即：试剂储存和准备区、标本制备区、扩增反应混合物配制和扩增区、扩增产物分析区(如使用全自动分析仪，区域可适当合并)。进入各个区域必须严格按照单一方向进行，不同的工作区域使用不同的工作服(例如不同的颜色)。工作人员离开时，不得将工作服带出。

影响无尘净化工程洁净度及选择气流速度的因素主要是：(1)室内污染源：建筑物组件、人员数量及操作活动、工艺设备、工艺材料及工艺加工本身等都是尘粒释放源，根据具体情况而异，变化很大;(2)室内气流流型及分布：单向流要求均匀、平等的流线，但会受到工艺设备布置和位置变动及人员活动情况等的干扰形成局部涡流;而非单向流要求充混合，避免死角及温度分层。

净化室工程共包含下列功用室：主实验室：该实验室为主体实验室，规划的净化等级为三十万级—十万级。更衣室：该实验室用于放置更衣柜，进主实验室之前的替换衣服和鞋运用。缓冲室：该实验室为ICP仪器室的一个缓冲室，用作隔离实验室外部的尘土充满到仪器室内。风淋室：思考更高净化等级的请求，关于本实验室的实际请求，能够不选用。