氟苯尼考长期使用可能会引起消化机能混乱和维生素缺乏或二重染症状。在防治猪病时，应小心谨慎，要按照规定的剂量和疗程给药，不能滥用氟苯尼考，避免产生不良后果。功能不全患畜要减量或延长给氟苯尼考间隔时间。如遇低温，发现氟苯尼考溶解速度较慢；或已配好的溶液有氟苯尼考沉淀析出，只需稍微加温（不超过45℃），即可全部快速溶解。所配溶液在48小时内用完。氟苯尼考对于猪的妙用还是很多的，可以治猪的很多疾病，但在使用的过程中也要注意使用，信赖不依赖，更好使用。

使氟苯尼考以分子状态包合于，大幅度增加了溶解度，常温下按氟苯尼考计可达到3000ppm，溶解速度快，搅拌即可溶解；同时，在高浓度20000ppm（以氟苯尼考计）条件下8小时不沉降，为均一乳浊液，可满足使用加药器饮水给药母液浓度的需求。氟苯尼考的主要作用机制是抑制细菌蛋白质的合成。细菌细胞蛋白质的生物合成在核蛋白体中完成，而核蛋白体有大、小两个亚基，是参与蛋白质生物合成过程中的两个重要因子；酰胺醇类素可与细菌核糖体的50s亚基（细菌专属）不可逆性结合，从而抑制细菌蛋白质的合成，致使细菌繁殖受到强大的抑制作用。 体内外试验表明，其活性明显优于当前的其他药，如：甲砜、四环素及氨苄青以及目前广泛应用的喹诺酮类。能透过血脑屏障，对动物的效果非其它抑菌药能比。如按推荐量用，克服了甲砜所致的再生的危险及其他毒性，不会对动物和食物造成危害，防治猪的呼吸系统疾病肠道及产后综合症等。

但氟苯尼考可与四环素类，如强力联用。氟苯尼考有血液系统毒性，虽然不会引起不可逆的再生，但其引起的可逆性红细胞生成抑制却比氯（已禁用）更常见。接种期或功能严重缺损的动物禁用。只有水溶性和脂溶性都很好的药其生物利用度才会高。运用了包合技术显著改善了氟苯尼考的溶解度，运用了促吸收技术增加药在肠道内的停留时间，从而提高了它的生物利用度。体内外试验表明，其活性明显优于当前的其他药，如：甲砜、四环素及氨苄青以及目前广泛应用的喹诺酮类。能透过血脑屏障，对动物的效果非其它抑菌药能比。如按推荐量用，克服了甲砜所致的再生的危险及其他毒性，不会对动物和食物造成危害，防治猪的呼吸系统疾病肠道及产后综合症等。