所有管路在天花板下面布设，并通过功能柱到中央台，边台的气体管路隐藏在实验工作台后面服务通道内。给水或其他液体管道在高点设有排气装置，排除积存在管道内的空气或其他气体，以防止气阻造成运行失常。管道如不能自由地伸缩，就会产生巨大的附加应力。通过气瓶和输送管道将载气输送给仪器，在气瓶出口装有单向阀，可避免更换气瓶时有空气和水分混入，另外在一端安装泄压开关球阀，将多余的空气和水分排放后再接入仪器管道，保证仪器用气的纯度。

集中供气系统采用二级减压保证压力的稳定，采用二级减压的方式，经过级减压后，干路压力比气瓶压力大大降低，起到了缓冲管道压力的作用，提高了用气的安全，降低了应用的风险。管子、管子联接件、阀门和设备上的进出接管间的联接方法，由气体的性质、压力和温度以及管子的材质、尺寸和安装场所等因素决定，主要有螺纹联接、法兰联接、承插联接和焊接等四种方法。所有管路的连接为无缝焊接。连接到阀门或调节装置时，才可以使用压力配件。

在温度变化较大的管道和需要有自由位移的常温管道上，需要设置膨胀节，使管道的伸缩得到补偿而消除附加应力的影响。为了排除凝结水，蒸汽和其他含水的气体管道应有一定的坡度，一般不小于千分之二。对于利用重力流动的地下排水管道，坡度不小于千分之五。所有气体管路都由高质量的、完全退火型、无缝连接的不锈钢管SS-316L组成。铜管只使用在气体管路的末端和气体纯度不是要求太严格的地方（比如通风柜）。