有机肥俗称农家肥，包括以各种动物、植物残体或代谢物组成，如人畜粪便、秸秆、动物残体、屠宰场废弃物等。

另外还包括饼肥（菜籽饼、棉籽饼、豆饼、芝麻饼、蓖麻饼、茶籽饼等）；堆肥；沤肥；厩肥；沼肥；绿肥等。

主要是以供应有机物质为手段，借此来改善土壤理化性能，促进植物生长及土壤生态系统的循环。

随着科学技术的不断发展，通过有益菌群的人工筛选、分离、驯化培养技术，将有益菌群接入无害化处理后有机肥中，可以生产出多种多样不同品种的生物有机肥，它能改善土质、减少环境污染、增肥增效等。

有机农业中使用的有机肥需经过有机认证机构的认证，符合有机产品的生产标准。近些年来，我国各种生物肥料发展迅速，年产量达数十万吨以上。

粪便与饼肥原料的有机肥成品密度小、手感轻、颜色浅、细腻程度较差，其中由于饼肥原料成本原因导致价格居高不下。 另外还有腐殖酸原料的有机肥。腐殖酸是一种天然的有机大分子化合物的混合物。目前作肥料的腐殖酸分为褐煤腐殖酸、风化煤腐殖酸、泥炭腐殖酸。因为成本低廉，一般有机肥厂家选用褐煤、风化煤腐殖酸，其有机质含量可以达到80%以上，但是必须经过活化处理，否则其养分的利用率很低。由它们生产的肥料密度大、手感中、颜色深、细腻度好。