生物有机肥施入土层不易过深。因为生物有机肥是依靠其活性来分解有机质的，其活性必须在一定的温度、湿度、透气性、有机物质的条件下才能实现。而施入太深会影响生物肥活性。因此，生物有机肥以施在地表下10 到15厘米处为宜。

生物有机肥施用时也不宜与单一化肥混施。 单一化肥因其成分单一，且酸碱程度不同，如果大量施用，势必影响生物有机肥的生物活性。因此，生物有机肥好单独施用。

通常人们说的有机肥多指的是商品有机肥，既符合国家***NY525-2012标准的肥料，其标准要求有机质≥45%，氮、磷、钾≥5%，水分≤30%。

在禽畜粪便中鸡粪的氮磷钾总量高，为4%。绿肥沤肥低为0.35~0.54。各类饼肥的氮磷钾含量都远高于粪肥，因为价格（多在2000-4000元/吨）较高，所以在饲料中应用较多。

有人可能问腐殖酸有机肥怎么不推荐？处于成本原因，一般肥料厂用的是褐煤、风化煤腐殖酸。但天然褐煤中的腐植酸水溶性能极低，而非水溶性腐植酸在亲水胶体性、阳离子交换性、生理活性、络合能力及较强的吸附和粘结能力等方面的基本特性是难以表现的。通过物理和化学的方法活化褐煤中的腐植酸，使水溶性腐植酸含量增加，改性后褐煤制作的腐殖酸肥料的农用价值和使用效果都会极大地提高。腐殖酸经过活化后，***又会降低。