离心机运转前应先切断电源并先松开离心机刹车，可以手试转动转鼓，看有无咬煞情况。检查其他部位有无松动及不正常情况。接通电源依顺时针方向开车启动（通常从静止状态到正常运转约需40-60秒左右）。通常每台设备到厂后均须空车运转3小时左右，无异常情况即可工作。物料尽可能要放置均匀。必须专人操作，容量不得超过额定量。严禁机器运转，以免影响机器使用寿命。机器开动后，若有异常情况必须停车检查，必要时需予以拆洗修理。离心机工作时是高速运转，因此切不可用身体触及其转鼓，以防意外。滤布的目数应根据所分离物料的固相颗粒的大小而定，否则影响分离效果。另外滤布安装时应将滤布密封圈嵌入转鼓密封槽内，以防物料跑入。


离心机的管理，从国内多年离心机的使用情况看，各类型离心机应由专人负责管理和维护。高、离心机要求定期检查维修，使用者应详细记录实验状态及维修情况，以保证离心机的安全使用。高、低速离心机由于操作简单，通过阅读说明书，训练离心机操作规程后可以自己使用。而离心机结构复杂，工作程序也较繁琐，使用不当易发生事故，特别对离心转头更应谨慎保养、使用。从国内多年使用、管理情况来看，专人保管、操作是仪器处于良好状态的保证。对管理、操作人员应进行培训，使他们不但熟悉操作，而且对仪器也应有所了解。


不同形式、不同技术性能的转头（Rotors）代表着离心功能，主要可概括为：（1）高速转头多用铝合金制作，经计算机三维计算优化设计，具有体轻、转速高等优点；（2）用碳纤维制造高速转头，容量大、重量轻、耐腐蚀性能强；（3）开发出大离心力转头，缩短了某些难以分离生物样品的分离时间，减少了浓度扩散作用，提高了分离纯度和分辨率；（4）角转头采取小倾角设计，兼有垂直转头沉降距离小、纵剖面面积大、分离时间短的优点，尤其适于质粒DNA、RNA分离。