内镜消毒时使用的消毒剂或灭菌剂浓度监测频率，不同的产品要求也不同，“规范”中做出了详细的说明，其原则是要求遵循产品使用说明书进行浓度监测；产品说明书未写明浓度监测频率的，一次性使用的消毒剂或灭菌剂应每批次进行浓度监测；重复使用的消毒剂或灭菌剂配制后应测定一次浓度，每次使用前进行监测；消毒内镜数量达到规定数量的一半后，应在每条内镜消毒前进行测定。同时,也指出了新规范中需要进一步完善的内容,为实际工作中的实施提供了依据。一些内镜消毒剂说明数一半后增加浓度监测频次，是因为即使强调了消毒前去除残留水份，也不可能达到完全干燥的程度，包括手工处理和机器洗消。每条内镜残存的水份会不断稀释消毒剂，消毒至规定的内镜数量的一半时，消毒剂出现浓度不合格的几率大大增加。国外有些产品说明书上甚至要求每条内镜消毒前都要对消毒剂进行浓度检测。

清洗槽清洗机应分开不同系统（如呼吸、消化系统）软式内镜的清洗槽、内镜自动清洗消毒机应分开设置和使用。“卫消证字”洗手液属消毒产品范畴这类洗手液能帮助杀灭或抑制常见致病菌，如如化脓性球菌、肠道致病菌、致病性真菌等。清洗过程会有残留细菌的污染，考虑到不同系统的内镜污染的细类不同，其对常用消毒剂抵抗力也不同，一旦交叉污染可能会造成，“规范”要求应分开。特别是支气管镜可能污染的分枝对抵抗力较强，与消化道内镜一同清洗易发生交叉污染。未来的发展若有理想的高水平消毒剂，则不需要强调不同系统的软式内镜清洗槽、内镜自动清洗消毒机分开设置。

灭菌的可行性与有效性

　　理想状态是一用一灭菌，我国有些地方对十二指肠镜做到了一人一用一灭菌、不少医院开展了定期灭菌。灭菌和二次高水平消毒需要考虑内镜的特点、灭菌方法的可靠性、工作机制可行性。

　　内镜的特点：内镜本身是影响消毒灭菌效果的关键因素。属于、价格贵、多有管路，管路难清洗，难观察、消毒灭菌不合格率较高、内镜内表面容易生长生物膜等。

　　灭菌的可靠性：杀灭所有微生物，保证灭菌水平。

　　灭菌方法：在选择灭菌方法时需要综合考虑，保证灭菌效果。