在进行MRM实验时，具有更短的停顿时间和驻留时间，同时不降低质谱数据质量（比如时间即使为几个毫秒，灵敏度不下降）。比如通常，Q2的电压为50V，相比以前仪器的1.9V，可以使离子获得更快的加速。

四、提供了线性加速的离子阱Linear Accelerated? Trap：更快的扫描速度，更快的分析时间

  提高线性离子阱灵敏度的原因来自于：（1）线性加速离子阱技术，是在线性离子阱内增加一轴向电压，目标离子在扫描前更向萃取区域集中（离子被浓缩）。

更短的离子阱碎片扫描时间，以前是几个毫秒，现在可到50微秒

优点：更高离子容量的线性离子阱灵敏度提高（阱的扫描灵敏度提高了100倍）扫描速度提高5倍（20,000 amu/sec）离子填充时间缩短20倍分辨率提高2倍（优于12,000）质荷比精度提高3倍

创新的AcQuRate?脉冲离子计数检测器：确保系统的重现性和性脉冲离子计数器是在某一时间内检测离子碰撞到电子倍增器时产生的离子脉冲

MRM实验中扫描的是一个质量数，所以扫描速度（2,000 amu/sec）已经远远超过了MRM实验的要求；过去制约速度的瓶颈是离子驻留时间，过去常需要几十毫秒，如果过短，数据质量会受到影响。对于MRM切换速度存在同样的瓶颈。

  5500的创新设计使其即使在2毫秒的驻留时间、2～3毫秒的MRM切换速度下，不降低数据质量

色谱的优势在于分离，为混合物的分离提供了有效的选择，但其难以得到物质的结构信息，主要依靠与标准品对比来判断未知物，对无紫外吸收化合物的检测还要通过其它途径进行分析。质谱能够提供物质的结构信息，用样量也非常少，但其分析的样品需要进行纯化，具有一定的纯度之后才可以直接进行分析。因此，人们期望将色谱与质谱联接起来使用以弥补这两种仪器各自的缺点。