柠檬酸为食用酸类，可增强体内正常代谢，适当的剂量对人体无害。在某些食品中加入柠檬酸后口感好，并可促进食欲，在中国允许果酱、饮料、罐头和糖果中使用柠檬酸。虽然柠檬酸对人体无直接危害，但它可以促进体内钙的排泄和沉积，如长期食用含柠檬酸的食品，有可能导致低钙血症，儿童表现有神经系统不稳定、易兴奋、植物神经紊乱；大人则为手足抽搐、肌肉痉挛，感觉异常，消化道症状等。

柠檬酸的生产方式比较灵活，水果提取、化学合成、微生物发酵等都可有效生产，但微生物发酵是经济、安全的方式。在菌选择上也比较宽泛，黑曲霉、棒曲霉、文氏曲霉、芬曲霉、丁烯二酸曲霉、橘青霉、解脂假丝酵母等众多菌都可采用，且对原料没有特殊依赖性，只要能通过微生物代谢产生柠檬酸即可，故柠檬酸的价格非常低廉，这也是其广泛应用的重要基础。

柠檬酸通过对肠壁的刺激，反射性地减慢胃排空速度，延长了食物在胃内的停留时间，使食物与胃液和睡液等消化液充分混合，增加食物的消化率，因此还能起到降低血糖徒增的风险。同时，柠檬酸能够降低肠道pH值，抑制有害菌的生产，维护肠道健康。柠檬酸能与钙形成更易吸收的有机化合物柠檬酸钙，从而促进机体对钙的吸收，对缺钙和骨质疏松具有一定的预防作用。

柠檬酸是一种重要的有机酸，无色晶体，常含一个结晶水，无臭，有很强的酸味，易溶于水。柠檬酸能够缓解土壤盐害，是一种优良的络合剂。土壤盐害也可以称作土壤盐渍化，是土壤深层水的盐分毛管水上升到地表，水分蒸发后使盐分积累在表层土壤的过程。在表层土壤中这些盐分包括钠，钾，钙，镁等的硫酸盐，氯化物，碳酸盐及重碳酸盐。