有机肥在土壤中分解，转化形成各种腐殖酸物质。能促进植物体内的酶活性、物质的合成、运输和积累。腐殖酸是一种高分子物质，阳离子代换量高，具有很好的络合吸附性能，对重金属离子有很好的络合吸附作用，能有效地减轻重金属离子对作物的***，并阻止其进入植株中。这对生产无污染的安全、卫生的***十分有利。

颗粒状有机肥设备，滚筒造粒机、转鼓造粒机、有机肥造粒机或者圆盘造粒或者对辊挤压挤压造粒等。有机肥生产工艺流程要求原料跟粉状肥基本一样，只是再需要添加粘结剂(膨润土或者凹凸棒)后，成品的颗粒需要转筒烘干机进行烘干。 还有一种有机肥，以牲畜粪便、生活垃圾、植物秸秆为主要原料，这种有机肥生产工艺流程大致为：原料干燥粉碎发酵调配(与化肥及其他有机-无机物质混合，使氮+磷+钾含量≥4%，有机质≥30%)造粒(或不造粒，粉状)包装。 假如原材料为腐植酸或泥炭，这种有机肥生产工艺里就没有发酵，可不必发酵，其余步骤同上。