在洁净手术室内，患者率可降低10倍以上，从而可以少用或不用会伤害患者系统的。既要无尘又要无菌是洁净手术室的特点。医院洁净室包括手术室、产科、婴幼儿病房、ICU(监护室)、病房及解剖室、净化实验室、人工透析室、标本室等，其工程质量与质量有着直接而重要的关系。医院洁净手术室的设计，我国《洁净室施工及验收规范》(以下简称“规范”)强调，新风必须遵循三级过滤的原则。

手术室处于负压状态，外面的空气则会不断从门下面流进房间，同时防止房间内滋生的气态污染微粒逸出，进入外面的走廊。举一个常见的负压室例子，一间带排气扇的浴室就是一间负压室。负压条件形成后，关闭浴室门，风扇就会阻止不好闻的味道和湿气逸出浴室。要产生负压状态，可通过平衡房间的通风系统，让自动排放的空气多于自动提供的空气即可实现。这样就造成通风不平衡，房间通风系统不断从房间外面吸进空气补充。在一间经过精心设计的负压室里，空气完全通过门下面的一个缝隙（一般大约半英寸高）流入。

洁净手术部的建筑装饰应遵循不产尘、不积尘、耐腐蚀、防潮防霉、容易清洁和负荷防火要求的总原则。洁净手术部内地面应平整，采用耐磨、防滑、耐腐蚀、易清洗、不易起尘与不开裂的材料制作。有特殊要求的，可采用有特殊性能的涂料地面。

洁净手术部内部墙面应使用不易开裂、阻燃、易清洗与耐碰撞的材料，墙面必须平整，防潮防霉，Ⅰ、Ⅱ级洁净室墙面可用整体或装配式壁板；Ⅲ、Ⅳ级洁净室墙面也可用大块瓷砖或涂料，缝隙均应抹平。