用户要先启动冷却水泵，检查水路循环是否正常，之后点动真空泵，使真空泵内的食用油等油液能正常运行，再使真空泵连续运转。随后启动排油泵开关，开始排油过滤杂质，油路正常循环，打开加热器开关，挥发食用油等油液中的水分。若水分太多则要打开放气控制适应的真空度，水分较少时则关闭放气阀。其四，当油液循环正常后，按下电加热启动按钮，对油液进行加热，温控仪通常设定为40℃—80℃。当油液温度升高到设定温度后，真空滤油机会自动关闭加热器，当油温低于设定温度时，加热器又会自动启动，以便保持加热均匀、恒温，减少温度忽高忽低对食用油等油液品质的影响，提高滤油质量。
假如它老化，也会导致真空泵漏油。此外，适配器上有一个毛毡垫，能够回收泵油。假如它充满了吸油，真空泵也会漏油。解决漏油的办法是更换老化的吸油窗、轴封、密封垫和吸收泵油的毡垫。保护完成后，应在注油前用泵油冲洗真空泵，并用溶剂清洗注油口的滤网，以保持油箱清洁。因为高速条件的构成需要很大的动力，简单发生振动，一般离心机还配有辅助加热设备，以进步油温，降低油的粘度。因而，整个真空滤油机具有很大的运行功率。
螺杆泵用于滤油机的优点是：运行平稳，流量稳定，噪音低，无涡流脉动，无剪切，从极低到极高粘度(-20~150)适应性强，自吸能力好。但缺点是定子和转子之间的摩擦力很大，需要很大的扭矩。效率低，轴通常吸收1kw的功率，制造商将配备3kw甚至更大的电机;泵的定子和密封件是消耗品;这种设计很纤细，需要很大的安装空间。传统的机油滤清器一般不使用这种类型。只有当整机配置需要特殊配置的泵时，该油泵才会用于匹配和提高整机性能。