杀菌锅根据不同的产品选择不同的杀菌方式；简单分类为：气杀和水杀。

气杀：也就是杀菌介质为蒸气。 早的时候这种杀菌方式就是应用于罐头产品的杀菌。目前国内外在罐头、饮料、蛋品、食用菌等行业应用广泛。

水杀：分为水浴式杀菌、喷淋式杀菌（顶淋、侧喷）、淋浴式杀菌等。

（二）加热方式：

杀菌锅根据客户现场的实际情况，可以选择不同的加热方式；常用的几种加热方式有：蒸汽加热锅炉、电加热加热、燃煤式加热锅炉、燃气式加热锅炉、生物颗粒式加热锅炉、导热油加热锅炉等。