医院的污水，除一般生活污水外，还含有化学物质、性废水和病原体。因此，必须经过处理后才能排放，特别是等病病房排出来的污水，须经消毒后才可排放。无集中式污水处理设备的医院，对有性的粪便，必须单独消毒使其无害化。常用消毒剂有漂、、次、臭氧。对含性同位素的污水，应按同位素处理要求处理。医院污水在处理过程中，沉淀的污泥含有大量的xi菌、病毒和ji生虫卵，须经消毒（常用熟石灰消毒）或高温堆肥后方可用作肥料。用此法对污泥消毒不产生臭气，并可改善污泥的脱水和沉降性，但费用较高。

医院排出的性废水常用贮存衰减法处理。医院常用的性同位素如131碘,32磷,198金，24钠等是半衰期较短的同位素，因此可以将性污水贮存于地下***衰变水池内,贮存时间为10倍于半衰期,把性浓度降到容许排放的程度。如果性污水的浓度很低，水量很小，也可用稀释法处理。中国的《性防护规定》要求每一微居里性同位素达到容许排放浓度需稀释水量1.67米3。当性污水浓度很高,性的半衰期很长，不宜用贮存法和稀释法处理时，可用蒸发法、离子交换法或凝聚沉淀法进行分离浓缩处理(见性废水处理)。小规模医疗废水生化处理常用工艺有：A/O工艺，MBR工艺，SBR工艺，CASS工艺。

医院属于大型综合医院，医院污水来源及成分复杂，含有病原性微生物、有毒、有害的物理化学污染物和性污染物等，具有空间急性和潜伏性等特征。主要指医院、病房、手术室、各类检验室、病理解剖室、室、洗衣房、太平间等所有与医院运营相关处排出的诊疗、生活及粪便污水，一类污染物及性废水经预处理达标后方可排入本污水处理站。此外，生活污水经化粪池、餐厅废水经隔油池后和医疗废水一并进入医院污水处理站处理，处理工艺采用 CAST工艺。2、加强一级处理效果宜通过两种途径实现：对现有一级处理工艺进行改造以加强去除效果和采用一级强化处理技术。