空调系统应能够对洁净实验室的净化等级参数进行综合控制
洁净空调系统分为集中式与分散式，集中式洁净空调系统又称中央空调，所有空气处理设备（风机、粗、中、过滤器、加热器、冷却器、加湿器、除湿器和制冷机组等）都集中在空调机房内，通过输送管道将精密控制处理后的空气分配给空气末端装置，送到净化实验室里，以不同换气次数和气流形式来实现洁净实验室不同的洁净级别。
这种空调系统热源和冷源集中，对空气的基本参数的调整易于实现，它处理空气量大，也便于净化参数控制，运行可靠，是目前大型集群式净化实验室的首1选方式。
分散式洁净室空调系统大多局限于局部实验室需要净化处理的情况，把单独的空调处理系统安置在净化实验室或净化实验室的不同区域，在出风口通过各类过滤器和净化装置如风机过滤单元（FFU）对空气进行净化处理，每一个末端处理系统可以单独对空气参数进行调节，也可以实现对不同净化实验室净化等级的控制。
三级生物安全洁净实验室(ABSL-3)设计是一项性较强的设计项目，在我国属刚启步阶段，对设计师还是一个新课题 ，有些设计经验还在不断探索和总结中。在新建、改建生物安全洁净实验室时，我们应注意以下设计要点：(1) 洁净实验室空调为负压净化空调系统，每一级压差梯度一般控制在-10—15Pa，洁净实验室工程，过大偏小均不安全。如主实验室无动物饲养，绝1对负压值可减小为-40Pa。 (2)洁净空调系统特点是全新风系统，由于它的特殊性，空调冷热源、洁净空调箱、排风过滤箱均应有备用设备，而且使用设备与备用设备之间应有瞬间切换控制功能。(3)洁净空调系统的送风口与排风口之间应尽量避免有阻挡。回风(排风)需下回风。而且排风口位置宜在生物安全柜附近。排风口应安装抗1菌过滤器。 (4)空调自动控制系统和监测系统。自动控制系统必须快速可调。监测系统必须与当地有关安全部门连锁。 (5)排风系统宜在负压段安装“Bag in and Bag out”过滤器装置，并通过排风管以12m/s速度向高空排放。
在ISO/IEC 17025《检测和校准实验室能力的通用要求》中，对洁净实验室的环境条件提出了明确的要求:“实验室应确保其环境条件不会使结果无效，或对所要求的测量质量产生不良响。”“相关的规范、方法和程序有要求，或对结果的质量有影响时，实验室应监测、控制和记录环境条件。对诸如生物消毒、灰尘、电磁干扰、辐射、湿度、供电、温度、声级和振级等应予重视，使其适应于相关的技术活动。当环境条件危及到检测或校准的结果时，应停止检测和校准。”
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