洋葱亚细胞定位的方法包括但不限于以下三种：

荧光法：利用抗原与的特异性结合，在细胞内产生荧光标记，亚细胞定位，从而确定细胞内抗原的分布位置。

GFP融合蛋白表达法：将目的蛋白与绿色荧光蛋白(GFP)融合，亚细胞定位找哪里，通过荧光显微镜观察绿色荧光蛋白的表达位置。

亚细胞分离法：通过一定的物理或化学方法，将细胞进行破碎，然后通过离心、密度梯度离心等方法将细胞器分离出来，再对分离出来的各个细胞器进行成分和结构分析。

双分子荧光互补（Bimolecular Fluorescence Complementation，BiFC）是一种用于研究蛋白质-蛋白质相互作用的强大技术。它利用荧光蛋白的特性，将两个不同的荧光蛋白片段（通常是黄色荧光蛋白和绿色荧光蛋白）分别与两个不同的蛋白质结合，以检测它们之间的相互作用。

BiFC的原理是基于荧光蛋白的特性，这些荧光蛋白可以发射出特定的光子，从而在细胞中产生荧光信号。当两个不同的荧光蛋白片段结合在一起时，它们会形成一个完整的荧光蛋白，并发出更强的荧光信号。因此，通过观察荧光信号的强度和分布，我们可以推断出两个蛋白质是否相互作用以及相互作用的确切位置。

为什么不先对一个基因做预测，在预测的结果上直接做共定位？

不同的预测网站有不同的计算方法，亚细胞定位公司，同一个基因在不同的预测网站也可能得出不同的定位结果。另外所有的结果都应是基于实验得到的，对于不清楚可能定位在哪里的基因，一般推荐先做普通定位，根据普通定位的结果再决定做哪种细胞器的共定位。

为什么有的基因做原生质体转化时荧光蛋白不亮？

不同物种的细胞可能对基因表达有影响，当在一种材料的原生质体中观察不到荧光时，可以考虑换一种受体材料。另外，如果是分泌蛋白，在原生质体中无法观察到荧光，此时可以考虑注射叶片来观察荧光。

拍摄时为什么有明场通道？

（1）显示细胞状态，有活力的原生质体细胞应该是饱满圆润的，变形或破碎的细胞说明此时细胞不是适状态或细胞已。

（2）显示荧光确实是细胞内蛋白表达的，而不是细胞碎片及杂质产生的杂光。

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