微生物在城市污水及工业废水处理中已经发挥了巨大作用。生物处理法主要包括活性污泥法、生物流化床、生物膜、氧化塘等，这些技术无论在设计理论还是实际运行管理方面，都已有比较成熟的经验。但 20 世纪以来，随着石油化工和有机化学工业的发展，人们生产和使用的有机物种类和数量不断增加，所需要处理的工业有机废水量也日益剧增，使得大量的人工合成、结构复杂的化合物或称异生质排入到水体中，传统的生物处理技术在处理这类污染物时遇到了一定的难度。

微生物处理菌剂的类型许多，按其产品中特殊的微生物菌种类型分成病菌菌剂、芽孢gan菌菌剂(如抗sheng素食用菌)、细菌菌剂(如菌根链格)、固氮蓝藻菌剂等；按其作用机理分成根瘤菌类菌剂、固氮菌类菌剂、解磷食用菌菌剂、解钾食用菌菌剂；按其产品含有物可分成单纯性的微生物处理菌剂和复合型(或复混)微生物处理菌剂等。随后在细分为不一样的功效，有用以水产品、农牧业、环境保护、废水处理等，各行各业中涉及到的微生物处理菌剂的操作方法和功效也是有所区别的。

微生物菌剂的技术指标：有效活菌数(cfu)，亿/g(mL) ≥2.0（颗粒≥1.0）；其中复合菌剂，每一种有效菌的数量不得少于0.01亿/g(mL)。微生物菌剂中的微生物大多是好气性的，如根瘤菌、自生固氮菌、磷细菌等。因此，施用菌肥必须配合改良土壤和合理耕作，以保持土壤疏松、通气良好。微生物菌剂内含有特定的某种微生物，通过其生命活动促进植物营养元素的供应量吸收，其作用机理有改善土壤的理化特性，提供植物所需的营养元素，改善植物对营养的吸收，使叶绿素含量增加，减少呼吸作用；