微生物菌剂具有反应时间短、微生物负载量大、耐冲击性强、固液分离效果优良、产生污泥少、便于操作等众多优点，能持久有效去除废水中的有机污染物，处理废水时具有较好的生物活性并能够生长繁殖，实现了微生物的重复利用;微生物菌剂用菌剂中不同种类的微生物菌互相配合、促进，使得废水处理效果明显提高，能降解氨氮、加快水体有机质分解速度，可以改良水质;

微生物处理菌剂主要作用：

1、提高土壤肥力：有些菌剂可以增加土壤中氮磷钾营养元素的含量；还可以提高一些土壤酶类活性，有利于土壤中养分的转化方便植物的吸收利用。另外，在微生物菌剂的帮助下会产生大量的二氧化碳，可提高土壤保水、保肥能力。

2、促进难溶的矿质营养释放：生物微生物菌剂使土壤酶活性提高，使不溶性土壤养分溶解利于植物吸收。同时，还分泌一些有机酸性物质，能分解有机质，产生的糖有利于固氮细菌的生长。

3、帮助农作物吸收养分：如根瘤菌可刺激豆科植物的根部形成根瘤，使土壤中的氮转化为作物能吸收的氮肥。

4、增强植物抗病（虫）能力。

5、增强植物的抗逆能力：有些生物微生物菌剂施用后，在土壤中大量生长繁殖，聚集在作物根部形成优势菌群，在其自身生长过程的同时，改善周围的环境，提高植物体的抗逆性。

6、提高作物品质。乳酸菌、嗜酸乳、凝结芽孢、枯草芽孢等可提高果实中必需氨基酸（赖氨酸和蛋氨酸）、维生素B族和不饱和脂肪酸等的含量。果实口感好，耐储藏，卖价高。

7、调节作物生长：生物微生物菌剂中的微生物在土壤中能释放如生长素、赤等，能够调控作物生长，进而有提高产量的效果。

微生物菌剂的好处与功效

微生物菌肥是根据土壤微生态学原理、植物营养学原理、以及现代“有机农业”的基本概念而研制出来的。微生物菌肥是以微生物的生命活动导致作物得到特定肥料效应的一种制品，是农业生产中使用肥料的一种。

正确施用微生物菌肥，能降低化肥用量、降低生产成本、改良土壤结构、消除土壤板结、改善作物品质、提高商品率，显著提高经济效益，是理想的生产资料。