在鱼菜共生系统中，菜的种植就是采用就是水培、雾培以及基质培，在这里的基质培只能选用岩棉基质。对于水培与雾培来讲，它营养成分主要是来源养殖中鱼的粪便进行一系列的发酵，形成作物生长需要的肥料。这个与传统的无土栽培基本类似，经过植物吸收后，还会流入到养殖区域，不过经过种植设施的水需要经过过滤处理，才能再次流入到养殖区域中。




硝化床栽种法：养殖水体与种植系统分离，两者之间通过砾石硝化滤床设计连接，养殖排放的废水先经由硝化滤床（或槽）的过滤，硝化床上通常可以栽培一些生物量较大的瓜果植物，以加快有机滤物的分解硝化。经由硝化床过滤而相对清洁的水再循环入水培蔬菜或雾培蔬菜生产系统作为营养液，用水循环或喷雾的方式供给蔬菜根系吸收，鱼菜共生系统，经由蔬菜吸收后又再次返回养殖池，以形成闭路循环。这种模式可用于大规模生产，系统稳定。

环保：鱼菜共生养殖系统不依赖人工肥料和其他补充剂。从鱼塘收集的粪便和其他废物被用来为农场添加营养。这种类型的耕作提高了土地的生产力并确保鱼类不受影响。良好的节水计划：这种耕作系统需要很少的水来实现大生产。与在阳光明媚的日子里需要许多升水来维持农作物的花园农业不同，水可以大大节省。鱼塘的水也用于灌溉农作物。

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