医院中常用的污水消毒方法主要有化学法与物理法，其中化学法中加氯消毒方法应用较为广泛，如、二氧化氯、漂、次等消毒剂。医院中采用加氯消毒工艺的原因在于其操作简便，对细菌等病原体的杀灭能起到较好的效果，水处理设备，但存在的局限性也不容忽视。
【灭杀病毒的效果较差】
通过传统加氯消毒工艺应用于医院污水消毒过程中分析，采用此工艺对许多如大肠菌群、沙门氏菌等菌群的去除率极高，而对病毒取出所达到的数量级。
尤其对肠道病毒进行灭杀时，由于其忍受力更强于肠道致病菌或大肠菌群，水处理设备系统，在通过次进行处理之后，仍可在排放的污水中检测出一定数量的病毒。因此，肠道致病菌或大肠菌群阴性无法确定病毒致病危险是否存在。
【消毒副产物对生态安全的影响】
如前文所提，一部分医院往往为保证实现良好的消毒效果，会投加过量的消毒剂，当余氯过高时便会使卤代烃含量逐渐增加，使其发生突变，水处理设备技术服务，威胁人体健康与生态环境，如消毒过程中使用过量的次可能生成AOX，对水源以及水生生物体会产生持久、潜在的毒性影响。
【受污水水质的影响较大】
污水中包含许多有机、无机污染物，对其进行消毒处理时，需使用大量的消毒剂，并且病原微生物与消毒剂的接触以及消毒剂实际的消毒效果都会受到一定的影响。另外，对污水系统处理是否稳定也使影响消毒效果的重要因素之一。
污水处理典型的工艺——生物脱氮除磷工艺(A/A/O)
污水首入厌氧池与回流污泥混合，在兼性厌氧发酵菌的作用下，废水中易生物降解的大分子有机物转化为聚磷菌可以吸收小分子有机物(如VFA)，并以PHB的形式贮存在体内，其所需的能量来自聚磷链的分解。随后，废水进入缺氧区，反硝化细菌利用废水中的有机基质对随回流混合液带入的NO3- 进行反硝化。
废水进入好氧池时，废水中有机物的浓度较低，聚磷菌主要是通过分解体内的PHB而获得能量，供细菌增殖，同时将周围环境中的溶解性磷吸收到体内，并以聚磷链的形式贮存起来，随后以剩余污泥的形式排出系统。系统中好氧区的有机物浓度较低，正有利于该区中自养硝化菌的生长。
厌氧、缺氧、好氧三种不同的环境条件和不同种类的微生物菌群的有机配合，能同时具有去除有机物、脱氮除磷的功能;工艺简单，水力停留时间较短;SVI一般小于100，不会发生污泥膨胀;污泥中磷含量高，一般为2.5%以上;厌氧-缺氧池只需轻缓搅拌，使之混合，而以不增加溶解氧为度;沉淀池要避免发生厌氧-缺氧状态，以避免聚磷菌释放磷而降低出水水质和反硝化产生N2而干扰沉淀;脱氮效果受混合液回流比大小的影响，水处理设备价钱，除磷效果则受回流污泥中挟带DO和态氧的影响，因而脱氮除磷效果不可能提高。
一体化污水处理设备隔栅井的作用是将废水中的悬浮物、杂质隔离，可以避免影响后期设备的处理。上述措施确滤和反冲洗只能通过过滤器盖或排气管的间隙进行。小型设备及材料的运送选用载重汽车运送，人力或吊车卸车，卸车后用人力或叉车搬运至地址。接触氧化池的作用：当厌氧池的水流入接触氧化池中的污水与接触氧化池中的氧化细菌（立体弹性填料）充分接触后污水就分解成COH2O，通过鼓风机的作用将水中的CO2排出。
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