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DNA 探针为原位杂交提供较高的灵敏度。与RNA探针相比,DNA探针与靶mRNA 分子的杂交强度较弱,因此在杂交后的洗涤中不应使用甲醛。
探针特异性至关重要。如果已知细胞中mRNA或DNA的确切核苷酸序列,则可据此设计高度的互补探针。如果超过 5% 的碱基对不互补,那么探针只能与靶序列发生轻度杂交。这意味着,探针更容易在洗涤和检测步骤中被洗去,可能无法正确检测。
预杂交
1)每个管中置换成大约300ulHYB-溶液,60℃水浴5分钟,避免振荡。
2)用等体积的HYB+取代HYB-。
3)60℃水浴,预杂交4小时以上。
杂交
1)吸去预杂交的HYB+,加上100ul已加入探针的HYB+溶液(探针浓度约为1ng/ul)..
2)60℃ 温浴过夜。
注:杂交与预杂交的温度可以是55到60度不等,温度越低,探针结合越好,温度越高,背景越小。
植物组织原位杂交的步骤包括以下几个方面:
1. 制备组织样品:从植物中取出需要研究的组织样品,如根、茎、叶等。
2. 固定组织样品:将组织样品固定在载玻片上,荧光原位杂交,通常使用或乙醇等化学物质进行固定。
3. 处理组织样品:对固定的组织样品进行脱水、透明化、脱脂等处理,以便于DNA探针的穿透和结合。
4. 制备DNA探针:根据需要研究的基因序列,设计并合成DNA探针。DNA探针可以标记荧光染料或性同位素,以便于检测。
5. 杂交DNA探针:将DNA探针与组织样品进行杂交,通常需要在高温下进行,以便于DNA探针与RNA或DNA结合。
6. 检测杂交信号:通过荧光显微镜或计数器等设备,检测DNA探针与RNA或DNA的结合情况,确定目标基因的表达模式和位置。
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