原位杂交技术（in situhybridization）是以标记的核酸分子为探针，在组织细胞原位检测特异核酸分子的技术。使含有特异序列、经过标记的核酸单链即探针，在适宜条件下与组织细胞中的互补核酸单链即靶核酸发生杂交，再以自显影或细胞化学方法对标记探针进行探测，从而在细胞原位显示特异的DNA或RNA分子。

可以检测cRNA、miRNA、LnRNA、DNA。可以各种种属的标本，包括哺乳动物、爬行动物、菌、植物标本。也可以检测组织芯片。

预杂交

1）每个管中置换成大约300ulHYB－溶液，60℃水浴5分钟，避免振荡。

2）用等体积的HYB＋取代HYB－。

3）60℃水浴，预杂交4小时以上。

杂交

1）吸去预杂交的HYB＋，加上100ul已加入探针的HYB＋溶液（探针浓度约为1ng/ul）..

2）60℃ 温浴过夜。

 注：杂交与预杂交的温度可以是55到60度不等，温度越低，探针结合越好，温度越高，背景越小。

原位杂交技术在其他生物领域也有广泛的应用，例如：

植物学研究：在植物学研究中，原位杂交技术可以用于检测和定位特定基因的表达，植物组织原位杂交，研究基因组结构和进化。此外，还可以应用于植物染色体组型分析、基因组印记研究等方面。

微生物学研究：在微生物学领域，原位杂交技术可以用于研究细菌、病毒等微生物的基因表达和定位，以及它们在环境中的分布和相互作用。例如，通过标记特异性探针，可以检测肠道微生物群落中的特定，研究其在人体健康和疾病发生中的作用。

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