首先，分子病理诊断为的诊断及鉴别诊断提供了依据，当遇到少见疑难或罕见病例时，尤其是通过形态学和免yi组化染色仍不能确定的类型，这时候就需要借助分子病理技术，从基因水平来判断疾病的异常情况，植物基因组原位杂交技术服务，协助病理医生作出相对准确的诊断并判断该疾病的预后及转归。应用领域广泛的要数软组织和骨、淋巴造血系统，因为这些系统的相似而不同，单靠镜下表现和已知的已无法满足诊断需求。另外，分子病理检测也常常运用在分子分型中，比如大家熟知的分子分型，通过基因表达谱研究，可将分为管腔A型、B型，HER-2阳性型，基底样型。



分子病理检测的意义：

通过分子检测协助病理诊断

　　某些肿1瘤具有特定的分子病理学改变，对于病理常规染色难于诊断的这些肿1瘤，进行分子病理检测可协助得出准确的病理诊断。例如淋巴1瘤的鉴别诊断往往依赖于形态和免1疫组化的综合判断，但有些时候，这些手段也不能满足诊断的需要，这时我们通过IG或TCR基因重排检测，可协助鉴别淋巴细胞的普通增殖和肿1瘤性增殖。

分子病理学是与分子生物学、细胞遗传学等学科相互渗透，在蛋白质和核酸等生物大分子水平上研究疾病病因、发病机制、形态变化及功能损害等方面发生和发展规律的新的分支学科，对疾病的病因、发展、发病机制及形态变化，从传统形态学概念深入至分子或基因水平，分子病理已成为肿1瘤病理研究中重要的内容和手段。①细胞特异性mRNA转录的定位，可用于基因图谱，基因表达和基因组进化的研究；

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