目前，鱼菜共生行业中对于“鱼”的选择中比较成功的大概是：罗非鱼、鲤鱼、鲫鱼、草鱼、宝石鲈鱼、池塘淤泥、加州鲈鱼、澳洲淡水石斑鱼等，而观赏鱼可以喂养锦鲤、斗鱼、金鱼等。另外还有南美对虾，在鱼菜共生模式有不少的成功案例，毕竟南美对虾的价格还是不错的。

鱼菜共生系统中的菜，它只是作物附属的产品存在，原因上面也简单说了，大体就是这个意思。而对于这个菜的种植方式而言，基本以无土栽培模式。其中也就是水培模式或者基质栽培模式，主要是利用鱼粪给蔬菜种植的养分供给。

硝化床栽种法：养殖水体与种植系统分离，两者之间通过砾石硝化滤床设计连接，养殖排放的废水先经由硝化滤床（或槽）的过滤，硝化床上通常可以栽培一些生物量较大的瓜果植物，鱼菜共生系统，以加快有机滤物的分解硝化。经由硝化床过滤而相对清洁的水再循环入水培蔬菜或雾培蔬菜生产系统作为营养液，用水循环或喷雾的方式供给蔬菜根系吸收，经由蔬菜吸收后又再次返回养殖池，以形成闭路循环。这种模式可用于大规模生产，系统稳定。


UVI模式是很早的鱼菜共生商业化生产型系统[6]，由养殖区、矿化区（沉淀、过滤和硝化池）、种植床三个板块组成（图2），种植床采用深液流栽培方式（DFT）。养殖产生的有机废弃物质在沉淀、过滤、硝化的环节中逐步矿化后，被输送到种植区，为植物的生长提供了大部分的营养物质，植物吸收净化后的水体再回到养殖区，实现养殖水体的循环利用。

但生产型UVI系统的后期维护，对技术的要求较高。UVI模式系统中，微生物多样性受人为控制因素（PH、T 、DO）的影响而受到破坏，因而，UVI系统需要根据水质理化指标向系统中加入微生物制剂，以维持微生物的多样性来确保营养物质的有效矿化。此外，部分有机物质在沉淀之后被排放到了系统之外，而溶解于水体当中的有机物质满足不了植物生长对营养的需求，这导致了UVI系统早期植物缺素的生理异常，同时养殖水体酸等一系列问题都需要技术维护来保持系统的生态平衡。

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