DNA 探针为原位杂交提供较高的灵敏度。与RNA探针相比，荧光原位杂交，DNA探针与靶mRNA 分子的杂交强度较弱，因此在杂交后的洗涤中不应使用甲醛。

探针特异性至关重要。如果已知细胞中mRNA或DNA的确切核苷酸序列，则可据此设计高度的互补探针。如果超过 5% 的碱基对不互补，那么探针只能与靶序列发生轻度杂交。这意味着，探针更容易在洗涤和检测步骤中被洗去，可能无法正确检测。

植物原位杂交除了在遗传育种方面的应用，还在其他领域有着广泛的应用，包括：

植物基因研究：植物基因是一种利用基因工程技术来人类遗传疾病的方法。通过植物原位杂交技术，原位杂交，可以将人类基因导入到植物细胞中，并在植物细胞中表达出相应的蛋白质，为基因提供重要的物质基础。

植物抗性研究：植物原位杂交技术可以用于研究植物对环境胁迫的抗性机制，例如抗旱、抗盐、抗病等，染色体荧光原位杂交，有助于了解植物在环境胁迫下的生理和分子响应机制。

植物比较研究：通过植物原位杂交技术可以比较不同植物之间基因表达模式的差异，从而为植物分类和进化研究提供重要的参考依据。

原位杂交是一种非常重要的技术，因为它可以在细胞或组织的自然环境中研究基因表达和调控。它可以帮助科学家们了解基因在特定组织或细胞类型中的作用和功能，以及在疾病发生和发展过程中的变化。此外，这项技术还可以用于检测基因变异和染色体异常，以及监测细胞生长和凋亡。

虽然原位杂交是一项非常有用的技术，原位杂交检测，但它也有一些限制。首先，探针的特异性可能受到干扰，导致错误的结果。其次，探针的数量和位置可能受到细胞或组织中其他成分的影响。此外，这项技术的操作比较繁琐，需要专门的技术和设备，而且需要大量的实验和对照才能获得可靠的结果。

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