瓜尔胶就分子结构来说是一种非离子多糖，它以聚甘露糖为分子主链，D-吡喃甘露糖单元之间以β（1-4）苷键连接。而D-吡喃半乳糖则以α（1-6）键连接在聚甘露糖主链上。瓜尔胶中甘露糖与半乳糖单元之摩尔比为2∶1，即每隔一甘露糖单元连接着一个半乳糖分支。文献中报道，自制瓜尔胶粉，瓜尔胶的分子量在220000左右。瓜尔胶分子的*大特点也即*大优点便是与纤维素结构非常相似，这种相似性使它对纤维素有很强的亲和性，称之为直接性（substantivity）。

这一正电荷改性瓜尔胶可与负电荷性化学纤维及填充料颗粒相互影响，改进原助留、助滤及提高实际效果。此外一个改善方位是提升了瓜尔胶分子结构链的长短，提升了它的相对分子质量，瓜尔胶厂家，进而提高了它的桥接工作能力。阳离子瓜尔胶在凉水中融解，与阳离子木薯淀粉对比具备非常大的优势。除此之外，很多木薯淀粉分子结构呈螺旋状，而瓜尔胶分子结构呈网盘直链构造。因而瓜尔胶的活性官能团比阳离子木薯淀粉更非常容易贴近化学纤维，因而瓜尔胶的阳离子木薯淀粉可做到小量的阳离子木薯淀粉能够做到的应用实际效果。

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为了更好地提高瓜尔胶的性能指标，一般对瓜尔胶开展有机化学改性。根据在分子结构链上引进阳离子基，使其具备一定的正电荷，是瓜尔胶改性的关键方位；比如在溶剂中，用季铵盐3-氯-2-羟丙i基氯铵与瓜尔胶原粉醚化制得阳离子瓜尔胶。

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