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由于大型实验室下水管道复杂，应采取必要措施避免管道堵塞渗漏，PCR实验室整体设计规划，如养成良好的用水习惯、放置滤网、设置存水弯、弯头采用45°角连接等。集中供水系统由于成本较高，水质不稳定，因此不推荐使用。为了避免二次污染，可采用感应式水，缺点是容易坏。为了美观，热水器可采用内置式的即热式电热水器。
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实验室建设是一个复杂的系统工程，是对工作环境的构建以及环境造就出的工作方式，而不是仪器和家具的简单组合。实验室设计应先于土建设计。“构”应先于“建”，只有“构”清楚了，才可以开始“建”。就是用专门的手段将抽象构思进行具体实现的过程，包括实验室设计、安装、调试、维护和升级等。
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实验室家具的选择首先应考虑能充分满足工作所需，主要涉及到台面材质、柜体结构与材质、颜色搭配等要素。例如前处理室应采用耐酸碱的陶瓷板台面、仪器室应采用理化板台面等。
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