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染色体原位杂交实验的基本原理是利用特定标记的已知碱基序列的核酸探针,依据碱基互补配对原理,与中期染色体玻片标本中的同源 DNA 序列进行杂交。
标记可以用放1射性同位素(3H、35S、32P),然后进行放1射自显影;也可以用非放1射性的荧光素生物素、地1高辛,再用荧光显微镜进行观察,即荧光原位杂交(fluorescent in situhybridization,FISH)技术。

20世纪80年代的DNA原位杂交开启了分子病理检测的大门,随后相继出现了在组织切片上的原位杂交,目的是检测肝1炎和肝1癌组织中的乙1肝1病毒。之后,越来越多的肿1瘤相关基因被发现,一批用于检测靶向治1疗药1物靶点的分子病理技术迅速问世,如FISH检测乳1腺癌HER2基因扩增、ARMS法检测肺1癌1基因突变等。
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