有机棉被采收后，首先要经历清棉，将棉纤维上的杂质和油脂处理干净后，才能方便纺纱进行；清棉后需要经过包装储存、运送至纺纱厂。 全程有机的后半程就在这里开始了。全程有机认证的有机棉，其清棉工厂需要得到有机认证，过程中不添加任何化学助剂，只使用天然提取的生物酶、淀粉来进行棉花纤维的清理；随后包装储存也是符合有机生产认证。